期刊简介
本刊前身《生理科学》”于1981年创刊，1984年为国内统一刊物面向全国公开发行，1990年正式改名为“基础医学与临床”，为我国仅有的几份基础医学与临床医学相结合的综合性杂志之一，由北京生理科学会主办。刊物自2005年起改为月刊。每期设专题综述（约请有关专家撰写本专题的现状与最新进展，并紧密结合临床）或医学论坛、学术论文及短文、最新技术与方法等栏目。另新设栏目有：协和CPC、协和内科大查房、临床园地、医学教育、短篇综述、新闻点击、科普沙龙。现为北京市优秀期刊及中国自然科学核心期刊。
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首页>基础医学与临床杂志
- 杂志名称：基础医学与临床杂志
- 主管单位：北京市科学技术协会
- 主办单位：北京生理科学会
- 国际刊号：82-358
- 国内刊号：1001-6325
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：北京市优秀期刊（91）期刊收录：上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
沙门氏菌Ⅲ型分泌候选基因yiiG的比较基因组分析
程希；胡跃明；郭志荣；汪业军
关键词：yiiG, 沙门氏菌, Ⅲ型分泌系统, 效应蛋白, 比较基因组
摘要：目的：研究沙门氏菌Ⅲ型分泌候选基因yiiG的分布和进化。方法利用序列比对检测yiiG分布，通过比较基因组学和进化树重建分析基因进化史。结合RNA-seq数据，分析yiiG和其他沙门氏菌毒性基因表达相关性。生物信息预测YiiG蛋白是否含有公认的Ⅲ型分泌系统（T3SS）分泌信号。结果 yiiG在S．enterica种内enterica亚种高度保守，在其他亚种多变；S．bongori种内无分布。在沙门氏菌外其他菌属中，仅在部分志贺氏菌和大肠杆菌中有yiiG分布。所有yiiG所在基因组近邻区域位置保守。 S．enterica种内enterica亚种的大量血清型中，yiiG基因上游存在一个head-to-head排列的高同源未注释基因（ yiiGRrc）。 RNA-seq数据分析揭示yiiG在细菌侵染环境刺激下表达、表达水平和T3SS相关毒性基因高度相关。各种新效应蛋白预测软件分析提示YiiG具有T3SS分泌／转运信号。结论 yiiG基因座为一个古老、遗传重组活跃的热点区域；yiiG与沙门氏菌毒性高度相关；另外，新鉴定的yiiG密切相关基因yiiGRrc，为进一步理解yiiG基因家族及其功能分化研究奠定基础。
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