期刊简介
本刊前身《生理科学》”于1981年创刊，1984年为国内统一刊物面向全国公开发行，1990年正式改名为“基础医学与临床”，为我国仅有的几份基础医学与临床医学相结合的综合性杂志之一，由北京生理科学会主办。刊物自2005年起改为月刊。每期设专题综述（约请有关专家撰写本专题的现状与最新进展，并紧密结合临床）或医学论坛、学术论文及短文、最新技术与方法等栏目。另新设栏目有：协和CPC、协和内科大查房、临床园地、医学教育、短篇综述、新闻点击、科普沙龙。现为北京市优秀期刊及中国自然科学核心期刊。
往期目录
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首页>基础医学与临床杂志
- 杂志名称：基础医学与临床杂志
- 主管单位：北京市科学技术协会
- 主办单位：北京生理科学会
- 国际刊号：82-358
- 国内刊号：1001-6325
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：北京市优秀期刊（91）期刊收录：上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版)
一种新的沙门氏菌成簇重复序列的预测方法
程希；郭志荣；胡跃明；汪业军
关键词：重复序列, 沙门氏菌, PipMaker, 成簇的, 规律间隔的短回文重复序列, 数目可变串联重复序列
摘要：目的：建立一个新的、直观的鉴定和显示细菌基因组成簇重复序列的方法，了解沙门氏菌基因组成簇重复序列的组成特征。方法直接将细菌的基因组用滑动窗口法切割成重叠片段，每一个片段自体比对，利用PipMaker生成共线性图。通过共线性图特征识别成簇重复序列区。结果用所设计方案－成簇重复序列预测器（ CRpred）对鼠伤寒沙门氏菌LT2菌株基因组进行扫描，总共鉴定出151个成簇重复区。特征分析表明，这些成簇重复区包含低拷贝简单串联重复、高拷贝简单串联重复、间隔串联重复、反向回文重复和反向间隔重复等5种类型。此外，沙门氏菌基因组中有9个复杂重复区域无法使用上述模式进行归类。结论提出了一个新的、简便直观的基因组成簇重复序列的鉴定方法，为搜寻成簇的、规律间隔的短回文重复序列（CRISPR）、数目可变串联重复序列（VNTR）以及其他重复序列相关研究提供支持。
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